Las clamidias zoonóticas con reservorios en mamíferos son Chlamydophila abortus, Chlamydophila felis, y posiblemente Chlamydophila pneumoniae. Estos organismos son miembros de la familia de las Chlamydiaceae, un grupo poco común de bacterias intracelular obligadas. Se considera que los miembros de esta familia son gramnegativos debido a su relación con otras bacterias gramnegativas, pero son difíciles de teñirse con Gram. Tienen diferencias metabólicas y estructurales con la mayoría de las bacterias, incluso una dependencia con el trifosfato de adenosina (ATP) y el guanosín trifosfato (GTP) del huésped. Su ciclo presenta dos formas: un cuerpo elemental infeccioso, metabólicamente inerte y un cuerpo reticulado, metabólicamente activo que sólo se encuentra dentro de las células.